Szeroko pojęte zagadnienia teorii gromadzenia zasobów (theory of storage). W szczególności problemy dotyczące sterowania i optymalizacji różnorodnych systemów ekonomiczno-organizacyjnych.
W centrum zainteresowań naukowych dr Tomasza Pisuli znajdują się również zagadnienia związane z analizą i oceną szeroko pojętego ryzyka oraz wykorzystaniem metod ilościowych w zarządzaniu ryzykiem (zwłaszcza ryzykiem rynkowym, bankowym oraz kredytowym)